O juiz condenou o padre Berrigan, então com 47 anos, a três anos de prisão federal. Philip Berrigan, que havia sido acusado em protestos anteriores, recebeu uma sentença mais longa.

Em 1970, depois que os apelos terminaram, o padre Berrigan recusou as ordens de se apresentar na prisão federal em Danbury, Connecticut. Ele passou à clandestinidade, fugindo de esconderijo em esconderijo e passou quatro meses se esquivando de uma caçada do FBI. Depois de muitas pistas falsas, ele foi pego em Block Island, na costa de Rhode Island. Dias antes de ser capturado, ele falou em uma igreja no bairro de Germantown, na Filadélfia, dizendo: “Escolhemos ser rotulados de criminosos da paz por criminosos de guerra”.

Ao longo das décadas, as incursões do padre Berrigan na academia também incluíram passagens pela Cornell University, Loyola University New Orleans, DePaul University e University of California em Berkeley.

Durante os anos da Guerra do Vietnã e depois, ele acreditava que as universidades haviam se tornado ferramentas do governo, militares e gigantes corporativos.

Sem um ministério convencional, o padre Berrigan operou por mais de 40 anos em uma pequena comuna conhecida como West Side Jesuit Community na West 98th Street em Manhattan. Ele se aliou a Dorothy Day e ao pacifista Movimento dos Trabalhadores Católicos e fez amizade com Thomas Merton, o monge trapista que também estava se afastando da piedade sacerdotal convencional ao condenar o envolvimento dos Estados Unidos no Vietnã.

Em 1968, o padre Berrigan viajou com Howard Zinn, o ativista político liberal e historiador, para o Vietnã do Norte em um esforço bem-sucedido para trazer de volta três pilotos americanos capturados. O padre Berrigan era afiliado a vários grupos católicos anti-guerra e mais tarde ministrou a pacientes com AIDS.

Em 1980, ele e seu irmão Philip foram fundamentais na formação do Movimento Ploughshares, uma coalizão de pacifistas que eram frequentemente presos por atos de desobediência civil em bases militares e outros locais, incluindo uma instalação de mísseis nucleares na Pensilvânia.

Entre os presos estava o ator Martin Sheen, que disse: “Madre Teresa me levou de volta ao catolicismo, mas Daniel Berrigan me mantém lá”.

Em 1965, o cardeal Francis Spellman, um apoiador da Guerra do Vietnã, disse aos superiores jesuítas do padre Berrigan para tirar o agitador da cidade de Nova York. Berrigan foi enviado para a América do Sul, mas ver as condições nas favelas do Peru e do Brasil o tornou mais militante, não menos. Ele acreditava que a Igreja Católica muitas vezes ficava do lado dos ricos e criticava a política externa dos Estados Unidos que incluía a venda de armas para regimes militares de direita.

O padre Berrigan mirou em seus companheiros jesuítas quando escreveu “Dez Mandamentos para o Longo Curso” (1981).

“Os jesuítas são mestres da invenção”, escreveu ele em seu provocativo manifesto. “Eles saem da cultura, sabem tomar seu pulso, experimentar seus ventos e endireitar suas velas. Nada extravagante, nada à frente de seu tempo, nada muito rápido. Consenso! Consenso!”

O padre Berrigan escreveu mais de 40 livros, incluindo uma autobiografia de 1987, “To Dwell in Peace“. Ele escreveu vários volumes de poesia, incluindo “Time Without Number” (1957), que ganhou o prêmio de poesia Lamont, e “Prison Poems” (1973).

Seu irmão Philip morreu em 2002. Entre os sobreviventes está uma irmã.

Em uma entrevista de 2008 na revista Nation, o padre Berrigan repetiu uma frase de Madre Teresa de que as pessoas espirituais deveriam se preocupar mais em ser fiéis do que em ter sucesso.

“O bem deve ser feito porque é bom, não porque vai a algum lugar”, disse ele. Acredito que se for feito com esse espírito, chegará a algum lugar, mas não sei para onde. . . . Nunca me interessei seriamente pelo resultado. Eu estava interessado em tentar fazer isso de forma humana, cuidadosa e não violenta e deixar para lá.”